在台灣端午節連假期間，針對一名中國男子駕駛快艇穿越台灣海峽進入接近台北的港口後被捕，外界質疑國安出現大漏洞。國安局長蔡明彥表示，近年中國偷渡來台者，都有幾個共通的樣態，不禁會讓人懷疑是否背後有組織、系統性的規畫。中國政府星期三(6月12日)表示，該事件純屬其“個人行為”，台灣不應過多懷疑。不過，此事件已引發台灣安全官員的警戒。
在台灣和中國關係持續緊張之際，台灣海岸巡防署人員星期天(6月9日) 在接近台北的淡水沿岸地區逮捕了這名駕快艇、宣稱要“投奔自由”的阮姓男子，並移送檢方偵辦。淡水河口、台北港、新北八里海灘為戍守台灣首都政經中樞的“防衛鐵三角”， 阮姓男子行為引發軍事意圖臆測。
該名60歲阮姓男子自稱“自己來自福建福州，來向中華民國投誠”，因為被中國限制出境，才來“投奔自由”、要來投靠中華民國。
台灣海巡署星期二(6月11日)召開記者會坦承相關人員2大疏失，第一、沙崙雷達操作員於淡水外海6海浬就鎖定該目標，但人員誤判為一般返港的國籍漁船，雖然有通報淡水第二漁港及八里安檢所人員實施目標辨識，但沒有及時調派巡防艇前往攔截登檢。
第二、八里安檢所便是該船並非台灣籍漁船後，沒有在第一時間通報查緝，相關人員確實有疏失，海巡署已依規定追究相關人員疏失，謝慶欽也表示，有關懲戒名單，星期二(6月11日)上午海巡署召開考績評議會，針對北部分署分署長到雷達操作所人員共10位人員，分別處以申誡到記過的處分。海巡署指出，此案件是人為誤判及疏失導致，海巡監偵系統沒有漏接，海巡署近10年已經查獲中國非法入境人士119人，今年至今已驅離809艘中國越界船舶。
海巡署副署長謝慶欽進一步指出，為了避免雷達光點辨識不易，造成類似誤判，海巡署刻正導入更多的科技輔勤，如雷達搭配紅外線熱像儀的「環島岸際智慧型監控系統」，逐步充實無人機等海空立體巡查機制，也全力推動我國漁船全數安裝AIS系統，並持續落實人員的教育訓練，強化與友軍的協調聯繋，以嚴密監控應處海面目標，確保我國國境安全。
現場媒體詢問，中國籍男子是否有掌握台灣人員交班時間，謝慶欽強調，9日上午9點44分雷達鎖定光點之後，在9點52分雷達操作員就通報巡邏人員協助辨識跟加強嚴密監控，接下來10點就是交班時間，而這艘船在海上航行將近12小時，應未掌握我方交班時間，是單純的人為誤判及疏失。
至於海委會主委管碧玲透露，駕駛快艇闖淡水的阮男曾在解放軍擔任海軍艦艇艇長，謝慶欽表示，根據阮男初步供稱他確實曾任中國海軍人員，但目前已經不是相關人員，細節部分因偵查不公開，不便透露。
台灣海委會主委管碧玲星期二(6月11日)表示，該男子是前中國海軍艇長，可能正在探測台灣的防禦狀況。台灣國防部長顧立雄同日也指出，這不排除是中方持續採用的「灰色襲擾」手法，台灣將提高警覺。
台灣國安局長蔡明彥今日赴立法院外交及國防委員會報告“國家如何運用民間通信設施蒐羅國安資訊”並備質詢。民進黨立委陳冠廷關切有關近日中國籍男子駕快艇闖入淡水河口一事，指出2、3年前亦有數名中國男子駕橡皮艇到金門說要投奔自由，詢問國安局有無掌握這些人的背景和動機。蔡明彥表示，從去年至現在，中方偷渡至台灣的案件約有十數件，都有針對案件當事人偵訊，再移送檢方調查，有無違反相關出入境及國安法規。
陳冠廷以韓國為例，該國情報部門都會查核脫北者的動機，國安局是否也有掌握?蔡明彥答覆，這些人在接受偵訊的過程中都有一套說詞，除說明自己身份之外，還會說明到台灣動機。
蔡明彥說，國安局會比對他們相關說詞，並指出有幾個需要注意的樣態，首先是他們都會提到投奔自由的想法與共通性，也會說明如何透過水上載具到台灣，一個是在通霄外海，一個是前兩日的淡水事件。
蔡明彥說，“國安局會依據他們攜帶的手機，勾勒其數位足跡，會了解他們的手機內容與數位足跡，與其證詞是否一樣，手機也有相關照片，會再核對其陳述內容是否有違反事實。整體來說有發現到相關資訊與陳述內容有吻合性，所以國安局會不禁懷疑，背後是否有組織、系統性的規畫，來操作水上載具到外離島或本島周邊水域或碼頭，靠近我國境。”
中國國台辦發言人陳斌華星期三在北京的例行記者會上表示，該男子的行為「純屬其個人行為」。他補充說:“民進黨當局沒有必要草木皆兵，煞有介事進行政治操弄”，並稱該男子回到中國後將會依照相關規定對其進行處罰。但陳斌華並未透露具體細節。
學者分析，這次快艇事件屬解放軍刻意挑釁或測試台軍交戰準則的「灰色襲擾」機率不低。
台灣淡江大學國際事務與戰略研究所助理教授林穎佑接受美國之音(VOA)訪問時表示，台灣前國防部長邱國正3月7日於立法院質詢時表示，已研議將交戰準則(Rules of Engagement , ROE)納入軍方戰備規定，但一週內，中國就兩度派出無人機侵擾台灣離島金門的二擔島上空，拍攝當地駐守部隊的運作並在網上曝光。
台灣新任國防部長顧立雄6月6日才於立法院備詢時提及，一旦中共攻擊台灣的航機艦、設施或攻擊台灣本島、離外島及任何飛航實體未經許可進入12浬領空、領海，台灣軍方就可行使自衛權，按比例進行自衛反擊。兩天後，6月8日就有中國民用無人機飛抵金門上空投擲傳單，並經由抖音進行網路直播。
林穎佑說，中方挑釁意味已相當濃厚，沒想到，接踵而來的是6月9日的快艇直闖淡水河事件。
新加坡國立大學政治系副教授莊嘉穎也持相同觀點，他以電郵回復美國之音採訪，指兩岸近期突發的海上爭端或資訊輿論操作，包括本週快艇闖進淡水河或金門海域2月時發生的海上爭端等，分析恐都是中方刻意為之，旨在凸顯台灣防衛缺失，以求消耗台灣防衛力或達到不戰而屈人之兵的效應。
台灣國防院中共政軍與作戰概念研究所研究員柯永森受訪表示，該名男子駕快艇開了十幾個小時，體力、耐力都有經過訓練，況且在中共嚴密監控下，1艘快艇要從中國出港不是那麼容易，此事某個程度上有上面默許，在測試台灣北部的海防。
柯永森研判，如果是沒有能力的一般人，要如何躲過情監偵雷達？此人應該事先有掌握海上雷達的死角，不然怎會到近海5、6浬，海巡單位才發覺，更有辦法成功闖入淡水河口，絕不可能是個人行為。
柯永森指出，對方應該對台灣的作戰圖象有所了解，此事是在測試北部海域有哪些路徑是雷達死角，觀測海象、演練要走的路徑，以便思考中共解放軍東部戰區海軍及相關單位要如何整合。
柯永森強調，國台辦聲稱是個人行為，講了一些撇清關係、推卸責任的場面話，但這件事不只是灰色地帶威脅，而是直接切入我國領海，中國快艇已進入12浬內，中國對台灣北部的威脅已經越來越大。
顧立雄星期二表示，未來台灣軍方將擴大對海巡署的支持，互相協作，共同強化承平時期第一線海防的國防。台灣海委會主委管碧玲則強調，面對中國可能有系統的測試台灣海防，海委會有中長期計畫。